Es ist nicht möglich, eine PCI-e-Karte in einen PCI-Steckplatz einzustecken. Die Anschlüsse für die beiden Standards sind unterschiedlich und es ist kein Adapter zur Konvertierung zwischen ihnen verfügbar.
PCI-e-Steckplätze und -Karten verfügen über mehr Pins und größere Anschlüsse als PCI-Steckplätze und -Karten. PCI-e unterscheidet sich auch elektrisch von PCI:PCI-Geräte arbeiten mit 3,3 V, während PCI-e-Geräte entweder mit 3,3 V oder 12 V betrieben werden können. Sie sind elektrisch nicht kompatibel und der Versuch, sie miteinander zu verwenden, kann zu schweren Schäden an der Hardware führen.