Es gibt verschiedene Möglichkeiten, eine PDB-Datei zu öffnen.
Verwenden Sie einen Texteditor.
PDB-Dateien sind reine Textdateien, sodass Sie sie mit jedem Texteditor wie Notepad oder WordPad öffnen können. Sie können die 3D-Struktur des Moleküls jedoch nicht in einem Texteditor anzeigen.
Verwenden Sie einen PDB-Viewer.
Es stehen viele verschiedene PDB-Viewer zur Verfügung, sowohl kostenlose als auch kommerzielle. Einige beliebte Optionen sind:
- PyMOL: Ein kostenloser Open-Source-PDB-Viewer mit einer Vielzahl von Funktionen.
- VMD: Ein kostenloser und quelloffener PDB-Viewer, der sich besonders gut für die Visualisierung großer Moleküle eignet.
- Chimäre: Ein kommerzieller PDB-Viewer, der für seine benutzerfreundliche Oberfläche und seinen umfangreichen Funktionsumfang bekannt ist.
Um eine PDB-Datei in einem PDB-Viewer zu öffnen, wählen Sie einfach den Menüpunkt „Datei“> „Öffnen“ und navigieren Sie zu der PDB-Datei, die Sie öffnen möchten. Der PDB-Viewer lädt dann die Datei und zeigt die 3D-Struktur des Moleküls an.
Verwenden Sie einen Webbrowser.
Es gibt auch eine Reihe von Webbrowsern, die PDB-Dateien anzeigen können. Einige beliebte Optionen sind:
- RCSB-Proteindatenbank: Die offizielle Website der Protein Data Bank, die eine große Sammlung von PDB-Dateien hostet.
- Mol* Zuschauer: Ein kostenloser und quelloffener webbasierter PDB-Viewer, mit dem Sie die 3D-Struktur von Molekülen in Ihrem Webbrowser anzeigen können.
- JSmol: Ein kostenloser und quelloffener Java-basierter PDB-Viewer, mit dem Sie die 3D-Struktur von Molekülen in Ihrem Webbrowser anzeigen können.
Um eine PDB-Datei in einem Webbrowser zu öffnen, kopieren Sie einfach die PDB-ID und fügen Sie sie in die Suchleiste des Webbrowsers ein. Der Webbrowser lädt dann die PDB-Datei und zeigt die 3D-Struktur des Moleküls an.
